Junaške ninja želve so mutirane želve, ki živijo v kanalizaciji New Yorka, kjer jih je našel njihov učitelj in mojster Splinter in izuril v močne in neustrašne bojevnike. Leonardo, Raphael, Donatello in Michelangelo, ki so svoja imena dobili po slavnih renesančnih umetnikih, se tako s Splinterjevo pomočjo borijo proti zlu, ki v New Yorku nikoli ne miruje. Njihov največji sovražnik je Shredder, zato bodo naredili vse, da ga ustavijo.
Four teenage mutant ninja turtles emerge from the shadows to protect New York City from a gang of criminal ninjas.