Prijatelji iz newyorškega živalskega vrta, lev Aleš, zebra Martin, povodni konj Slavka in žirafa Milko, so se po spletu nenavadnih okoliščin znašli na Madagaskarju, skupaj s četico pingvinov. Sedaj sklenejo, da se vrnejo nazaj v New York. Pingvini ‘mojstrsko’ popravijo staro strmoglavljeno letalo in tako družba odleti z otoka. Toda nekaj se zalomi, saj v zraku ostanejo samo kratek čas in se kar naenkrat znajdejo v Afriki. Tam prvič srečajo svoje sorodnike, ki svobodni živijo v divjini.
The animals try to fly back to New York City, but crash-land on an African wildlife refuge, where Alex is reunited with his parents.