Po tem, ko so se uprli Shredderju, ki je združil moči z norim znanstvenikom Baxterjem Stockmanom ter pomagačema Bebopom in Rocksteadyjem, se morajo bojevniški želvji bratje soočiti z največjim zlom dotlej: zloglasnim Krangom. Ustvarjalci akcijskih spektaklov "Podli fantje", "Armageddon" in "Transformerji" prinašajo nove zabavne avanture obešenjaških ninja želv Rafaela, Leonarda, Michelangela in Donatela, ki morajo znova reševati New York pred uničenjem. Njihov večni sovražnik Shredder, ki je ušel iz zapora, je iznašel način, kako lahko ustvari lastne mutante; poleg tega pa se nad mesto zgrnejo uničujoči robotski Nezemljani. Dodatne težave povzročajo nesoglasja med želvjimi brati, saj bi se s pomočjo Shredderjevega seruma lahko spremenili v navadne ljudi. K sreči se lahko zanesejo na modre nasvete podganjega učitelja Splinterja in na pomoč zveste prijateljice April. Priljubljeni bojevniški želvji bratje z imeni resničnih renesančnih umetnikov so svojo filmsko renesanso doživeli leta 2014, zdaj pa so pripravljeni na novo poglavje: zločin nikoli ne počiva, zato bodo mutirani borci za pravico in nepoboljšljivi zabavljači vnovič stopili iz sence.
After facing Shredder, who has joined forces with mad scientist Baxter Stockman and henchmen Bebop and Rocksteady to take over the world, the Turtles must confront an even greater nemesis: the notorious Krang.